Soruşturma dosyasına yansıyan iddialara göre, hastanın ateşi ölçülmedi, akciğer veya sinüs filmi çekilmedi, gözlem altında tutulmadı, çocuk doktoruna yönlendirilmedi, etkisiz bir tedavi uygulandı bu hastalığın ilerlemesine ve alt solunum yollarına sıçramasına neden oldu. Babanın diğer iddiaları ise şunlar: "Hijyen koşulları uygun değildi. Hastane mikrobu kaptı ve bu ölüme götürdü. Ciddi sağlık sorunu boğaz enfeksiyonu olarak kabul edildi ve boş yere zaman kaybettirildi."
Sağlık Bakanlığı, bazı medya kuruluşlarında “Acilde sahte doktor” başlığı ile duyurulan haber ile ilgili yazılı açıklama yapıldı. İstanbul Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesinden alınan bilgiye göre, Ali Haktan Yılmaz'ın, Tıpta Uzmanlık Sınavı’nda ilgili hastanenin Acil Tıp Kliniği’ni tercih ettiğini belirterek, klinikte gözlemci olarak bulunmak isteğinde bulunduğu ifade edildi. Açıklamada, “Adı geçen kişinin kısa bir süre klinikte bulunmasına izin verilmiştir. Ancak haberde iddia edildiği gibi reçete yazması, hasta muayene etmesi ve hekimlik faaliyetlerinde bulunması kesinlikle söz konusu olmamıştır. Konu ile ilgili soruşturma başlatılmıştır” denildi.