Cumhurbaşkanı Ahmet Necdet Sezer'in, Anayasa Mahkemesi üyesi iken hükümet-Çankaya arasındaki kararname krizinde hükümetten yana tavır aldığı ortaya çıktı. Dönemin Cumhurbaşkanı Turgut Özal'ın aleyhine karar veren isimler arasında yer alan Sezer, "Cumhurbaşkanının Bakanlar Kurulu işlemlerini siyasal yerindelik yönünden denetlemeyip imzalamak zorunda olduğu açıktır. Cumhurbaşkanının uyarı ve tavsiyede bulunmaktan öte direnmesi, sistemin özelliğine ters düşer" görüşüne imza attı. Anayasa Mahkemesi, 24 Nisan 1993 tarihinde 1993/18 sayılı kararında hükümet ile merhum Özal arasında yaşanan "Cumhurbaşkanının yetkileri ve Bakanlar Kurulu Kararnamaleri" tartışmasına son noktayı koydu. Yekta Güngör Özden'in mahkeme başkanı olduğu dönemde Sezer mahkeme üyesi olarak bu kararı imzaladı.