Ankara DGM, uzun süre kamuoyunun gündeminde yer alan bazı önemli dava ve soruşturmalarda, Türk Ceza Kanunu'nun 313. ve 314. maddelerine ilişkin suçların DGM'lerin görev alanından çıkarılmasından sonra, "görevsizlik" kararı verdi. DGM'de, "terör ve kaçakçılık" dosyaları kaldı.

Ankara DGM, 13 Aralık 2001 tarihinde yürürlüğe giren 4723 sayılı Yasa ile Türk Ceza Kanunu'nun (TCK) "cürüm işlemek amacıyla teşekkül oluşturmak" fiilini düzenleyen 313. ve "teşekkül üyelerine yardım" hükmünü içeren 314. maddelerinin DGM kapsamından çıkarılmasıyla çok sayıda davada, görevsizlik kararı vererek, dosyaları yetkili ve görevli ağır ceza mahkemelerine gönderdi. Görevsizlik kararı verilen soruşturmalar arasında "Mavi Akım" soruşturması da yer alıyor. Soruşturma kapsamında, eski BOTAŞ Genel Müdürü Gökhan Yardım hakkında "yurtdışına çıkış yasağı" konulmuştu