İstanbul Emniyet Müdürlüğü görevini 20 ay 10 gün yürüten ve seçim hükümetinde İçişleri Bakanı olarak atanan Selami Altınok'un makamına velaket edecek isim belli oldu. İstanbul Terörle Mücadele Şube Müdürlüğü, Bomba İnceleme ve İmha Şube Müdürlüğü ve Tanık Koruma Şube Müdürlüğü'nden sorumlu İl Emniyet Müdür Yardımcısı ve 1. Sınıf Emniyet Müdürü Mustafa Çalışkan, Altınok'tan boşalan makama vekâleten atandı. Çalışkan'ın paralel yapıya yönelik etkin mücadele sergilediği ve başarılı operasyonlara imza attığı biliniyor. Çalışkan döneminde ''Paralel Devlet Yapılanması''na yönelik sürdürülen soruşturmada “casusluk”' ve “'yasa dışı dinleme”' yaptıkları tespit edilen emniyet personeline yönelik operasyonlar düzenlendi.
IŞİD'e uluslararası katılımı engellemek için havalimanları ile otogarda “mülakat odaları” kuran Terörle Mücadele Şube Müdürlüğü ekipleri, yaklaşık 1 yılda 550 kişiyi riskli bularak, ülkelerine iade etti. IŞİD, Çalışkan ve ekibinin başarılı operasyonları sonrası İstanbul terör polisinden kurtulmanın yollarını anlatan 50 sayfalık İngilizce kitap yayımladı ve militanlarına Ankara, İzmir ve Antalya üzerinden Suriye'ye geçmeleri talimatını verdi.
Çalışkan'ın, paralel yapı tarafından uzun zaman tasfiye edilmeye çalışıldığı ve paralel yapı tarafından 'cemaate karşı icraatlar' uyguladığı gerekçesiyle fişlendiği biliniyor. Paralel yapının yayın organları Zaman ve Bugün gazeteleri, Çalışkan'ı hedef alan haberler servis etti.