Ergenekon iddianamesinin çarpıcı bölümlerden biri de Gazi Mahallesi'ndeki kanlı olaylara ilişkin olanıydı. 23 kişinin ölümüyle sonuçlanan ve günler süren olaylar zinciri, Gazi'de Alevi vatandaşların yoğun olarak bulunduğu kıraathanenin taranması ile başlamıştı. İşte bu kanlı saldırıyı, Ergenekon tetikçisi Osman Gürbüz'ün planlayıp yönettiği iddia ediliyor. Alevi-sunni ayırımını körüklemek üzere tetiklenen çatışmalar polis ve askerle vatandaşları karşı karşıya getirmiş, olaylarla yüzlerce kişi de yaralanmıştı. Gazi olayları, dönemin yerel yöneticileri ve askerlerin soğukkanlı tavrı sonucu daha da büyümeden yatıştırılabilmişti.