Cenk Tosun'nun aldığı 1.7 milyon Euro'yu emsal göstererek TL olarak aldığı ücretine Euro üzerinden hatırı sayılır bir zam isteyen Pektemek ve menajeri ile anlaşma zemini oluşturulamadı.
Yıllık 1.2 milyon Euro önerdikleri Mustafa Pektemek için Beşiktaş yönetiminin bu konuda tavrı "Mustafa Pektemek için belirlediğimiz rakam bellidir ve bütçemizi aşacak ücret artırımları yapmayacağız" şeklinde oldukça net.
Genç futbolcunun adının Fenerbahçe ile anılması ise resmi olarak söylenmese de menajer oyunu olarak görülüyor.
Beşiktaş'a geldiği 2011 sezonundan bu yana oynadığı futbol ve attığı gollerden çok sakatlık haberleri ile gündeme gelen Mustafa Pektemek'in sözleşme konusunda bu tarz bir sıkıntı çıkarması da ayrıca tepki görüyor.
2011 sezonunda Gençlerbirliği'nden Beşiktaş'a transfer olan Pektemek sakatlıkları dolayısıyla 50'den fazla maçta kadroda olmadı ve forma giydiği maçlarda 4 yılda toplma 16 gol atabildi
