Trabzonspor teknik direktörü Ersun Yanal’ın defans bloğunun güçlendirilmesi için mutlaka alınması yönünde rapor verdiği 22 yaşındaki savunmacı Aytaç Kara’nın transferi zora girdi. Ertuğrul Sağlam'ın istifa etmesi sonrası teknik direktörlüğe getirilen Michael Skibbe’nin, Başkan Mesut Hoşcan’la yaptığı görüşme sonucunda genç oyuncunun mutlaka takımda kalmasını istediği öğrenildi. Aytaç Kara, transferi şimdilik rafa kalktı.
Trabzonspor'un olaylı geçen son Genel Kurulu mahkemelik oldu. 25 üye, genel kurulun iptali için başvurdu. Dava dosyasında iki gerekçe öne çıkarken, bunlardan biri usulsüz divan seçimi, bir diğeri de Divan’a sunulan iki önergenin kabul edilmemesi oldu.
Transfer döneminin hareketli takımlarınan Trabzonspor, kaleci Zeki Ayvaz ile yollarını ayırdı. Bordo-mavililer, 2006-07 sezonunda Akçaabat Sebatspor'dan transfer ettiği genç kaleciyle sözleşmenin feshedildiğini borsaya bildirdi. Zeki, ligin ilk yarısında Balıkesirspor'daydı.