İlker Başbuğ'un da sanıkları arasında yer aldığı Darbe Andıcı davasına bakan mahkeme, davayı ikinci Ergenekon davası ile birleştirdi. Mahkeme gerekçe olarak, Yargıtay'ın aralarında irtibat olduğu gerekçesiyle Danıştay saldırısı ile Ergenekon davasını birleştirmesini gösterdi.
İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi, hükümeti yıpratmak amacıyla kurulduğu belirtilen internet siteleriyle ilgili görülen İnternet Andıcı davası ile ikinci Ergenekon davası'nın birleştirilmesine karar verdi. Özel yetkili Savcı Mehmet Ali Pekgüzel, 30 Mart'taki duruşmada iki dava arasında fiili ve hukuki irtibat bulunduğunu gerekçe göstererek birleştirilmelerini talep etmişti. Aralarında eski Genelkurmay Başkanı İlker Başbuğ ile eski 1. Ordu Komutanı Hasan Iğsız'ın bulunduğu sanıkların yargılandığı davada Pekgüzel, yargılamada gelinen aşama, delillerin birlikte değerlendirilmesindeki zorunluluk ve usül ekonomisinin dikkate alınmasını talep etmişti.
Mahkeme heyeti birleştirme kararının gerekçesinde, dosyalardaki belge içerikleri ve internet yayınları, telefon konuşma kayıtlarını gösterdi. Kararda, Yargıtay'ın Danıştay saldırısı ile Ergenekon davalarını birleştirmesine de atıf yapılarak şunlar ifade edildi: “Gölcük Donanma Komutanlığı aramalarında çıkan dosyamızı ilgilendiren tüm belgeler, birleştirilmesi istenilen dosya sanıkları arasındaki örgütsel bağlamdaki fiili ve hukuki irtibat iddiası, her iki dosyadaki eylemlerin iddia olunan Ergenekon terör örgütünün faaliyetleri kapsamında değerlendirildiği iddiası ve Yargıtay 9. Ceza Dairesi'nin aynı örgütün kuruluşu ve terör örgütü olarak tespit aşamasında görülmekte olan farklı dosyalar üzerinden yürütülen davaların bir arada yargılamaların yapılması gerektiği yönündeki içtihatları da göz önünde bulundurularak dava dosyalarının birleştirilmesine oy birliğiyle karar verildi.' Mahkeme heyeti ayrıca, bağımsız milletvekilleri Ahmet Türk ve Aysel Tuğluk ile BDP milletvekili Hasip Kaplan'ın davaya müdahil olma taleplerini ise reddetti. Davaların birleşmesiyle ikinci Ergenekon davasında sanık sayısı, 33'ü tutuklu 147'ye yükseldi.
Balyoz Darbe Planı davasının İstanbul 10. Ağır Ceza Mahkemesi'nde görülen dünkü duruşmasında ise, sanıklarla mahkeme heyeti arasında 'bilirkişi' tartışması yaşandı. Avukat Ali Sezenoğlu, getirdiği bilirkişinin duruşmada dinlenilmesini istemesi üzerine Mahkeme Heyeti Başkanı Ömer Diken, her sanık için tek tek bilirkişi dinlemenin mümkün olmayacağını, avukatların aralarında anlaşıp 3 kişilik uzman bir bilirkişi heyeti oluşturarak duruşmada dinletebilecekleri önerisinde bulundu. Emekli Orgeneral Ergin Saygun ise, İkinci Ergenekon davasının tutuklu sanığı CHP İzmir Milletvekili gazeteci Mustafa Balbay'a ait olduğu iddia edilen günlüklerde, eski MİT Müsteşarı Şenkal Atasagun'un 'birinci ordunun darbeye hazır' dediğine ilişkin bir ifade bulunduğunu belirterek, Atasagun'un tanık olarak dinlenilmesini istedi.
