Avrupa kupaları tarihinde Türk takımlarıyla 4 kez eşleşen ve 7 müsabaka oynayan Arsenal, normal sürelerde rakiplerine skor olarak hiç üstünlük vermedi. Bir Türk takımıysa 'Topçular'ı hazırlık maçı da olsa farklı mağlup etti. O takım, şu anda amatör ligde yer alan Kocaelispor.
Arsenal, Avrupa kupalarında 3 kez Fenerbahçe'nin, 1 kez de Galatasaray'ın rakibi oldu. Türk rakiplerine karşı çıktığı maçlarda 4 galibiyet ve 3 beraberlik elde eden İngiliz ekibi, 1999-2000 sezonu UEFA Kupası finalini penaltılarda Galatasaray'a kaybetti.
Bir Türk ekibiyle ilk kez 1979-80 sezonu Avrupa Kupa Galipleri Kupası'nda eşleşen ve 1. turda Fenerbahçe'yle karşılaşan Arsenal, ilk maçı evinde 2-0 kazanıp, İstanbul'da rakibiyle 0-0 berabere kaldı.
Ardından 1999-2000 sezonu UEFA Kupası finalinde Danimarka'nın başkenti Kopenhag'da Galatasaray'la karşı karşıya gelen Arsenal, normal süresi ve uzatmaları 0-0 eşitlikle geçilen müsabakayı penaltılarda 4-1 kaybetti ve Türk futbolunun Avrupa kupalarındaki ilk şampiyonluğuna Sarı-Kırmızılılar imza attı.
Fenerbahçe ile 2008-2009 sezonu UEFA Şampiyonlar Ligi G Grubu'nda eşleşen İngiliz ekibi, sarı-lacivertlilere İstanbul'da 5-2 üstünlük kurup, Londra'daki maçı ise 0-0 eşitlikle tamamladı.
Türk takımlarıyla son maçlarını geride kalan sezonda UEFA Şampiyonlar Ligi play-off turunda yine Fenerbahçe ile yapan İngiliz temsilcisi, müsabakaları 3-0 ve 2-0'lık sonuçlarla kazanmayı bildi.
Arsenal'ın Türk takımlarına karşı son yenilgisi, bu sezon Bölgesel Amatör Lig'de yer alan Kocaelispor'a karşı. İki takımın kamp yaptığı Avusturya'da 25 Temmuz 2001'de 'Swarowski Kupası' adıyla oynanan maçta Körfez ekibi, maça tam kadro çıkan rakibini Lazarov (2), Serdar ve Nuri'nin golleriyle 4-1 yenerken Arsenal'ın tek sayısını Ray Parlour attı (Parlour UEFA Kupası finalinde Galatasaray'a penaltıdan gol atabilen tek oyuncuydu).
O sezona Hikmet Karaman yönetiminde çok iyi giren, hatta Türkiye Kupası'nı kazanan Kocaelispor sonraki yıllar maddi darboğaza girmiş, geçen sezon 3. Lig'den düşmüştü.
