İlk kez Süper Lig'e 2007-2008 sezonunda çıkan İstanbul Büyükşehir Belediyespor, 2012-2013 sezonu sonunda 6 sezon kaldığı ligden düştü. Geçen sezon yer aldığı PTT 1. Lig'de şampiyon olarak yeniden Süper Lig'e yükselen lacivert-turunculu takım, sezon başında yeni bir yapılanmaya gitti. İstanbul Büyükşehir Belediyespor Kulübü'nden ayrılarak İstanbul Başakşehir Futbol Kulübü adını alan lacivert-turunculu ekip, teknik direktör görevine Abdullah Avcı getirildi.
İstanbul Başakşehir, İsim değişikliğinin ardından Spor Toto Süper Lig'deki ilk sezonuna Kasımpaşa maçıyla başlayacak.
İstanbul Başakşehir Teknik Direktörü Abdullah Avcı, 1028 gün sonra Süper Lig'de maça çıkacak. Ligde son olarak 6 Kasım 2011'de İstanbul Büyükşehir Belediyespor'un başında lig maçına takımını süren Abdullah Avcı, daha sonra A Milli Futbol Takımı'nın başına geçti. 20 Ağustos 2013 tarihine kadar ay-yıldızlıları çalıştıran deneyimli teknik adam, bu sezonun başında İstanbul Başakşehir'de teknik direktörlük görevine getirildi.
İstanbul Başakşehir, İstanbul Büyükşehir Belediyespor adıyla yer aldığı Süper Lig'de yaptığı 6 açılış maçında 2 galibiyet, 3 beraberlik ve 1 yenilgi aldı.
Lacivert-turunculu takım, Süper Lig'de sezon açılış maçlarının tamamını kendi sahasında oynarken, Fenerbahçe ve Galatasaray'ı mağlup etti. Beşiktaş'la iki, Eskişehirspor'la bir mücadelede berabere kalan İstanbul ekibi, tek mağlubiyetini Kayserispor'dan 2-0'lık skorla aldı.
Lacivert-turunculu takımın sezonlara göre Süper Lig'de yaptığı ilk hafta maçları ve aldığı skorla şöyle:
İstanbul Büyükşehir Belediyespor-Fenerbahçe: 2-0
İstanbul Büyükşehir Belediyespor-Eskişehirspor: 0-0
İstanbul Büyükşehir Belediyespor-Beşiktaş: 1-1
İstanbul Büyükşehir Belediyespor-Kayserispor: 0-2
İstanbul Büyükşehir Belediyespor-Galatasaray: 2-0
İstanbul Büyükşehir Belediyespor-Beşiktaş: 1-1
Yeni sezon öncesinde transferin en aktif takımlarından birisi olarak dikkati çeken İstanbul Başakşehir, geçen sezondan 10 futbolcuyla yollarını ayırdı, kadrosunda 10 yeni futbolcu dahil etti.
Transfer döneminde Spor Toto Süper Lig'in tecrübeli oyuncularıyla güçlenen lacivert-turunculu takım, dış transferde de 3 yabancı oyuncuyu kadrosuna kattı.
İstanbul temsilcisi, teknik direktör Abdullah Avcı'nın verdiği rapor doğrultusunda transferde kale, defans ve forvet hattına yoğunlaştı. Forvete Süper Lig'de gol kralı olmuş eski Fenerbahçeli Semih Şentürk'ün yanı sıra Fransız golcü Jeremy Perbet'i alan İstanbul Başakşehir, savunmada ise Ferhat Öztorun, Uğur Uçar, Yalçın Ayhan, Alexandru Epureanu'yu kadrosuna kattı.
Lacivert-turunculu takım, kale mevkisi için ise Galatasaray'ın eski kalecisi Ufuk Ceylan ile bir dönem Fenerbahçe forması giyen Manisasporlu Volkan Babacan'ı aldı.