2005-2006 sezonunda Konyaspor'a attığı galibiyet golüyle Galatasaray'ın şampiyonluğunda önemli pay sahibi olan Aydın Yılmaz, o dönemlerde geleceğin yıldızı olarak lanse edilmişti. 2015 yılına kadar Galatasaray'da inişli çıkışlı performanslar gösteren futbolcu, 2014 yılında Elazığspor'la oynanan kupa maçında ayağı kırılınca kariyerinde büyük bir düşüş yaşadı.
Önce uzun süre sahalardan uzak kalan futbolcu, sonrasında Galatasaray'dan gönderildi. 2015-2016 sezonu başında yeni bir başlangıç umuduyla Kasımpaşa'ya transfer olan Aydın Yılmaz, burada da sakatlığının etkilerini üzerinden atamadı. İstanbul kulübüyle sözleşmesi sona eren futbolcu yaz boyunca kendisine kulüp aradı ancak boşta kaldı.
Kariyerinde adeta dibi gören futbolcu, şimdilerde bireysel olarak idmanlarını sürdürüyor. Eski günlerine geri dönmek isteyen Aydın Yılmaz son olarak 26 Aralık 2015 tarihinde Trabzonspor'la oynanan Süper Lig maçında forma giymiş ve 1 dakika süre almıştı.
