İnönü Üniversitesi eski rektörü Fatih Hilmioğlu'nun, hükümet karşıtı bir toplantıda rektörlere hitaben "Örgütlenme uzun iş. En kestirme yoldan halletmek lazım" diyerek darbe kışkırtıcılığı yaptığı ortaya çıkmıştı.
Prof. Dr. Mehmet Haberal'la birlikte gözaltına alınan İnönü Üniversitesi eski rektörü Fatih Hilmioğlu'nun, Kemal Alemdaroğlu'nun yönlendirilmeleriyle üniversiteler arası kurulla ilgili seçimlerde meclise ve siyasi partilere baskı uygulamaya çalıştığı iddianamede yer aldı.
Ergenekon davasının birinci iddianamesinde dünkü operasyonda gözaltına alınan Prof.Dr. Fatih Hilmioğlu'nun İÜ eski rektörü Kemal Alemdaroğlu ile ilgili konuşmaları dikkat çekiyor. İddianamede Alemdaroğlu'nun, kendi görüşündeki insanları bu kurula seçtirmeye çalıştığı, bunun için Fatih Hilmioğlu'nu yönlendirdiği öne sürülüyor. Yine Fatih Hilmioğlu'nun 22 Temmuz seçimlerinden önce hükümet hakkında 'Ak Parti yüzde 95 oy alsa bile iktidara getirilmez, gerekirse darbe yapılır' sözleri iddianameye girdi.
İ.Ü. eski rektörü Kemal Alemdaroğlu ile İnönü Üniversitesi'nin eski rektörü Fatih Hilmioğlu arasında 9 Ocak 2008 tarihli telefon görüşmesinde üniversiteler arası kurulla ilgili seçimlerde kendine yakın kişileri seçtirmek için konuştukları görülüyor. Fatih Hilmioğlu, Alemdaroğlu'na hitaben, “Hocam dün Teziç'le konuştuk bu konuyu tamam mı yani adayı da kendisi de söyleyen o oldu hatta bana 2-3 gün önce söyledi. İlk adayımız da şeydi Celal Şengör'dü. Celal Şengör yan çizdi son anda. Bütün rektörleri de ben ayarladım. Hepsi bitti. Tabi 30'un üzerinde rektörü ayarladım ondan sonra. İTÜ'nün rektörü İTÜ'nün bak o ismi de ilk önce ben attım ortaya. Kemal Gürüz'le konuştum çok iyi olur dedi kendisi” sözleri dikkat çekiyor.
Rektörlerin YÖK Başkanı'na almış olduğu tavırla ilgili olarak Fatih Hilmioğlu'nun Kemal Alemdaroğlu ile 3 Şubat 2008 tarihli görüşmesi ise şöyle: F.Hilmioğlu: "Çünkü onlar da bırakmayacak hocam. Mecbur yani onlarda bağıracak bu sefer Anayasa Mahkemesi'ni değiştirmeye bağıracaklar: Yani onlar durmayacak. Mümkün değil yani. Onların da son şansı yani. Onlarda geldi geldi yani otuz yıldır, kırk yıldır hep böyle İslami formatta insanlar yetiştiriyor, devletin en tepelerini ellerine geçirdiler. Ama rejim bir türlü değişmiyor. Hala laik rejim bu nasıl iş diyor adamlar yani. O da son şans diye düşünüyorum üstelik yanlarına sadece AK Parti değil MHP de yanlarında DTP de yanlarında.
Ergenekon'un tutuklu sanığı Cumhuriyet Gazetesi Ankara Temsilcisi Mustafa Balbay'ın günlüklerinde de dün gözaltına alınan rektörlerin adı geçiyor. Kent Otel'deki görüşmeyi Balbay günlüğünde şöyle anlatıyor: “Kentte rektörlerle öğle yemeği. Dokuz Eylül Rektörü Prof. Emin Alıcı, Samsun 19 Mayıs Ferit Bernay, Malatya İnönü Prof. Fatih.., Bursa Uludağ Prof. Mustafa Yurtkuran, Mersin Üniv. Rektörü Prof. Uğur Oral, Trakya rektörü Prof. Osman İnci... Çukurova rektörü,.. Malatya çok heyecanlı...bu işi uzatmamak lazım. en kestirme yoldan halletmek lazım. Başka türlü zor. Böyle örgütlenmeler uzun iş...”
