Savcı Mehmet Şenay Baygın tarafından yürütülen soruşturma sonucunda hazırlanan iddianamede, her iki saldırının da Birleşik Özgürlük Güçleri'nin silahlı kanadı Aziz Güler Özgürlük Gücü Milis Örgütü tarafından gerçekleştirildiği kaydedildi ve 10 kişi hakkında dava açılması istendi.
Saldırılarda kullanılan araçların Halil Sönmez tarafından temin edildiği kaydedilen iddianamede, Sönmez ile Murat Can Emir ve Okan Kayar'ın saldırılar anında gazetelerin çevresinde telefon irtibatları belirlendi. Devrimci Parti Kadıköy binasında iki silah ele geçirildiği ve İl Başkanı Selim Polat'ın şüpheli olduğu kaydedilen iddianamede, Öncü Nesil Derneği'ne saldırıda yakalanan şüpheliler ile Yeni Şafak ve Yeni Akit'e saldırıların faillerinin bağlantılı oldukları ileri sürüldü. İddianamede Sönmez ve Polat dahik 10 kişi hakkında hapis istendi. Polat, Sönmez ve iki şüpheli halen cezaevinde.