Organize suç örgütü elebaşıları Sedat Peker ve Aalaattin Çakıcı'nın adına da iddianamede yer verildi. Peker 'sanık' sıfatıyla suçlanırken Alaattin Çakıcı'nın 'tanık' olarak ifadelerine yer verildi.
Çete lideri olmak suçundan tutuklu olan Alaattin Çakıcı'nın soruşturma sürecinde alınan ifadeleri, mafya tipi örgütlenmelerin ve çete liderlerinin Ergenekon örgütü tarafından kullanıldığını ortaya koydu.
İddianamede örgüt şeması, telefon irtibat şeması ve bir krokiye yer verildiği ifade edildi. Örgütün hücre yapılanması şeklinde örgütlendiği örgütün medya, mafya, istihbarat gibi farklı yaklaşık 20 departmandan oluşup her departmanın başında bir başkan ve bir yardımcının bulunduğu iddianamede yer aldı.
İddianamede, organize suç örgütü lideri Sedat Peker'in de sanık olarak yer aldığı öğrenildi. Kandıra F Tipi Cezaevi'nde kaldığı belirtilen terör örgütünün yöneticisi olduğu iddia edilen emekli Tuğgeneral Veli Küçük'ün, Peker'den avukat giderleri için bir havuz oluşturmasını talep ettiği öne sürüldü.
